stata配对样本t检验(肝癌研究进展)

谈风水 269 0

1.Modulation of YrdC promotes hepatocellular carcinoma progression via MEK/ERK signaling pathway.(新靶点,标志物,分子机制,基础研究)

Qing Li

Department of Clinical Pharmacology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha 410078, PR China; Institute of Clinical Pharmacology, Central South University, Hunan Key Laboratory of Pharmacogenetics, Changsha 410078, PR China; Engineering Research Center of Applied Technology of Pharmacogenomics, Ministry of Education, 110 Xiangya Road, Changsha 410078, PR China; National Clinical Research Center for Geriatric Disorders, 87 Xiangya Road, Changsha 410008, Hunan, PR China. Electronic address: [email protected]

Biomed Pharmacother. IF: 2.7590

越来越多的证据表明,参与生长,端粒内稳态,翻译的YrdC和tRNA的N6-苏氨酰氨基甲酰化(t6A)在肿瘤的进展中异常表达。然而,YrdC在肝细胞癌中的作用仍然难以捉摸。本研究旨在探讨YrdC在肝细胞癌中的临床意义和致癌表型,并确定其与该病的相关机制。通过使用GEO数据集,我们分析了YrdC在肝细胞癌(HCC)中的表达。 Kaplan-Meier生存分析用于评估肝细胞癌患者在TCGA中的预后意义。还进行了YrdC的体外增益和功能丧失分析,以评估其对致癌表型和相关信号传导途径的影响。 YrdC表达不仅在肝细胞癌组织中失调,而且与肝细胞癌患者的预后相关。此外,YrdC耗竭抑制了huh7细胞的增殖,迁移和侵袭能力,而YrdC过表达则相反。我们的数据还揭示了YrdC通过激活MEK / ERK信号通路促进了HCC的进展。总之,我们的研究结果表明,YrdC是肝细胞癌的潜在预后标志物,靶向YrdC的治疗策略可能有望改善肝细胞癌的治疗。

2.Combined Analysis of Metabolomes, Proteomes, and Transcriptomes of HCV-infected Cells and Liver to Identify Pathways Associated With Disease Development.(新靶点,代谢重编程,蛋白质组,代谢组,转录组,基础研究)

Thomas F.Baumert

Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, U1110, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques, Université de Strasbourg (IVH) Strasbourg F-67000, France; Université de Strasbourg F-67000, France; P?le Hépato-digestif, Institut Hopitalo-Universitaire, Strasbourg F-67000, France. Electronic address: [email protected]

Gastroenterology. IF: 18.3920

BACKGROUND & AIMS: 丙型肝炎病毒(HCV)感染,肝病进展和肝癌发生的机制只是部分了解。我们对HCV感染的细胞和嵌合体小鼠进行了基因组学,蛋白质组学和代谢组学分析,以了解有关这些过程的更多信息。

METHODS: 用培养物衍生的HCV感染Huh7.5.1dif(肝细胞样细胞)并用于RNA-Seq,蛋白质组学,代谢组学和整合基因组学分析。 uPA / SCID小鼠注射HCV感染患者的血清; 8周后,收集肝组织并通过RNA-seq和蛋白质组学进行分析。使用差异表达,基因集富集分析和蛋白质相互作用绘图,我们确定了响应HCV感染而改变的途径。我们对来自216名HCV感染和早期肝硬化患者的肝组织研究以及来自99名肝细胞癌患者的配对活检进行了验证,其中包括17名患有脂肪性肝炎的组织学特征的患者。根据相对过氧化物酶体功能将HCV感染患者的肝硬化肝组织分为2组;评估的结果包括Child-Pugh分级,肝细胞癌的发展,存活和脂肪性肝炎。根据脂肪性肝炎对肝细胞癌进行分类;结果是相对过氧化物酶体功能。

RESULTS: 我们在HCV感染的细胞中量化了21,950个mRNA和8297个蛋白质。在HCV感染肝细胞样细胞和嵌合小鼠后,我们观察到参与代谢和肝癌发生的mRNA和蛋白质水平的显着变化。肝细胞样细胞的HCV感染显着增加调节先天免疫反应的mRNA水平而不是蛋白质水平 - 我们认为这是由于这些细胞中翻译的抑制。肝细胞样细胞的HCV感染增加了葡萄糖消耗和代谢以及STAT3信号传导途径并降低了过氧化物酶体功能。过氧化物酶体介导非常长链脂肪酸(VLCFAs)的β-氧化;我们在HCV感染的细胞中发现了VLCFAs的细胞内积累,这也在脂肪肝患者中观察到。来自HCV感染小鼠的肝脏中的细胞具有与过氧化物酶体功能相关的mRNA和蛋白质水平的显着降低,表明过氧化物酶体的扰动。我们将过氧化物酶体功能的缺陷与患者的HCV相关性肝硬化,脂肪肝病和肝细胞癌的结果和特征相关联。

CONCLUSIONS: 我们对来自HCV感染的肝细胞样细胞和HCV感染小鼠的肝组织进行了联合转录组,蛋白质组和代谢组分析。我们发现HCV感染增加了葡萄糖代谢和STAT3信号通路,从而降低了过氧化物酶体功能;过氧化物酶体基因表达的改变与肝病患者的预后相关。这些发现提供了对肝病发病机制的见解,并可用于鉴定新的治疗靶点。

3.Co-delivery of sorafenib and VEGF-siRNA via pH-sensitive liposomes for the synergistic treatment of hepatocellular carcinoma.(新药研发,新制剂)

Na Zhang

Key Laboratory of Chemical Biology (Ministry of Education), Department of Pharmaceutics, School of Pharmaceutical Sciences , Shandong University , Jinan , People's republic of China.

Artif Cells Nanomed Biotechnol. IF: 5.6050

非病毒纳米载体提供药物和siRNA组合的平台,其重点是将药物和siRNA加载到单一载体中,允许在肿瘤部位共同递送和协同效应。在我们先前的研究中,组装了对pH敏感的羧甲基壳聚糖修饰的脂质体(CMCS-SiSf-CL)用于索拉非尼(Sf)和共载的Cy3-siRNA。本研究评估了共载脂质体的体外和体内共递送。此外,讨论了体外抑制pH敏感的索拉非尼(Sf)和VEGF-siRNA共载脂质体的肝细胞癌。实验结果证明了共同递送和穿透到二维(2D)培养的HepG2细胞,三维(3D)培养的HepG2肿瘤球体和携带H22肿瘤的小鼠的肿瘤区域。与游离siRNA和单载荷载体相比,共递送脂质体表现出增强的VEGF下调作用,诱导细胞早期凋亡。因此,CMCS-SiSf-CL输送系统可以为共同输送系统的开发奠定基础,并为HCC治疗提供新的领域。

4.Astrakurkurone, a Sesquiterpenoid from Wild Edible Mushroom, Targets Liver Cancer Cells by Modulating Bcl-2 Family Proteins.(天然产物,新药研发,新靶点,分子机制,基础研究)

Krishnendu Acharya

Molecular and Applied Mycology and Plant Pathology Laboratory, Department of Botany, University of Calcutta, Kolkata, WB, India.

细胞凋亡的诱导是现代化学治疗癌症的首选目标,其中缺乏有效的“靶标特异性”药物导致对来自天然来源的抗癌化合物的广泛研究。在我们的研究中,我们使用了astrakurkurone,一种从野生食用菌中分离出来的三萜,Astraeus hygrometricus。我们已经讨论了采用单晶X射线晶体学的astrakurkurone的结构和稳定性,并研究了其在肝细胞癌(HCC)细胞中的潜在致病性。我们的实验表明,在极低剂量下它对HCC细胞系(Hep 3B和Hep G2)具有细胞毒性。进一步研究表明,astrakurkurone通过诱导细胞凋亡,破坏线粒体膜电位和诱导Bcl-2家族蛋白(例如Bax)和下游效应caspase 3和9的表达起作用。分子对接研究还预测直接相互作用具有抗细胞凋亡蛋白Bcl-2和Bcl-xL的药物。因此,astrakurkurone可以成为未来抗癌药物常规谱的有价值的补充。

5.Characterization of pediatric hepatocellular carcinoma reveals genomic heterogeneity and diverse signaling pathway activation.(标志物,临床研究)

Sharon E. Plon

Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, Texas.

Pediatr Blood Cancer. IF: 2.5130

BACKGROUND: 小儿肝细胞癌(HCC)是儿童罕见的肝脏肿瘤,预后较差。用于了解该肿瘤的潜在基因组驱动因子的综合分子谱分析尚未完成,并且尚不清楚非纤维层儿科HCC是否在基因组学上与肝母细胞瘤或成人HCC更相似。

PROCEDURE: 为了表征这些肿瘤的分子景观,我们通过对一组癌症相关基因进行测序并进行拷贝数和基因表达分析,分析了一组15个儿科非FL-HCC。

RESULTS: 我们在Wnt信号传导基因中检测到多种类型的分子改变,包括APC转化,AMER1体细胞突变,以及最常见的CTNNB1基因内缺失。通过TERT激活或ATRX突变对端粒酶途径进行了多次改变。在20%的肿瘤中检测到MAPK / ERK信号传导途径基因(包括MAPK1和BRAF)中的可治疗靶向激活突变。在我们的儿科HCC队列中TP53突变发生的频率远低于成人队列中报道的。与没有潜在肝病史的患者相比,发现患有潜在肝脏疾病的儿童出现的肿瘤与其余患者在分子上不同,缺乏可检测的致癌驱动因素;两种类型的大多数都是磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3阳性,另一个潜在的治疗靶点。

CONCLUSION: 我们的研究显示,儿科HCC是一个分子异质的肿瘤组。在没有潜在肝脏疾病的情况下出现的那些非FL-HCC肿瘤具有影响多种癌症途径的遗传改变,最显着的是Wnt信号传导,并且与成体HCC具有一些共同特征。

6.GSTM1 and GSTT1 null genotype increase the risk of hepatocellular carcinoma: evidence based on 46 studies.(标志物,临床研究,meta分析)

Feng Xue

Department of Hepatobiliary Surgery, The 3rd Affiliated Teaching Hospital of Xinjiang Medical University (Affiliated Tumor Hospital), Urumqi, 830000 China.

Cancer Cell Int. IF: 2.7400

BACKGROUND: 众所周知,肝细胞癌(HCC)已成为全世界最危及生命的疾病之一。已经证明大量内部和外在因素与HCC有关,例如基因突变,病毒性肝炎和亚硝胺。虽然先前的研究表明谷胱甘肽S-转移酶(GST)基因型与HCC相关,但结论不一致。因此,我们进行了一项新的荟萃分析,以阐明无效GSTM1,GSTT1多态性与HCC风险之间的关系。

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METHODS: 我们搜索了PubMed,Web of Science,Embase和CNKI数据库,以选择符合纳入标准的合格研究,直到2018年7月31日。最后,我们在这个Meta分析中选择了41篇文章,6124个案例和9781个对照。我们使用OR和95%置信区间(CI)来评估GSTM1和GSTT1无效基因与HCC风险之间的相关性。所有统计过程均由Stata(版本12.0)执行。

RESULTS: 汇总分析显示,GSTM1无效基因型(OR = 1.37,95%CI = 1.18-1.59)和GSTT1无效基因型(OR = 1.43,95%CI = 1.23-1.66)均增加了HCC的风险。并且GSTM1-GSTT1双零基因型也增加了HCC的风险(OR = 1.58,95%CI = 1.22-2.05)。在亚组分析中,我们在按种族分层时获得亚洲人的显着结果,结果为GSTM1无效OR = 1.44,95%CI =(1.22-1.71),GSTT1无效OR = 1.48,95%CI =(1.25-1.77) ),GSTM1-GSTT1 null OR = 1.58,95%CI =(1.19-2.09),而我们在高加索人或非洲人中没有获得显着结果。对对照类型的分层分析表明,与健康人群中GSTM1,GSTT1单一基因型和GSTM1-GSTT1双缺失基因型相关的HCC风险较高。除GSTT1单一无效外,未发现慢性肝病(CLD)存在显着关联的证据。

CONCLUSIONS: 我们的研究表明,携带GSTM1,GSTT1单一基因型和GSTT1-GSTM1双零基因型的个体更有可能发展为HCC。

7.HBx-K130M/V131I promotes liver cancer in transgenic mice via AKT/FOXO1 signaling pathway and arachidonic acid metabolism.(炎-癌转换,分子机制,新靶点,基础研究)

Vincent W. Keng

Department of Applied Biology and Chemical Technology, Hong Kong Polytechnic University [email protected]

Mol Cancer Res. IF: 4.9740

慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染仍然是全球肝细胞癌(HCC)的高度潜在原因,而其背后的遗传机制仍不清楚。该研究阐明了由主要是亚洲基因型B HBV及其常见HBx变体的HBV X(HBx)基因诱导的肿瘤发展的机制。为了比较K130M / V131I(Mut)和野生型(WT)HBx对HCC的潜在致瘤作用,使用睡美人(SB)转座子系统将HBx Mut和WT递送到富马酰乙酰乙酸水解酶(Fah)的肝脏中 - 缺陷小鼠和转化相关蛋白53(Trp53)缺乏的背景下。根据我们的结果,HBx Mut具有比其WT变体更强的致瘤作用。此外,HBx实验动物中明显存在炎症,坏死和纤维化。在HBx Mut过表达下检测到具有增加的上游丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT)磷酸化的叉头盒O1(FOXO1)的减少。因此,提出HBx Mut通过AKT的磷酸化还原FOXO1来增强疾病进展。在代谢组水平上,HBx改变了参与花生四烯酸(AA)代谢的基因的表达,这是由于肝脏中前列腺素和白三烯等促炎因子的积累引起的炎症。总之,在K130M / V131I突变X蛋白的慢性乙型肝炎患者中观察到的HCC增加率可能是由于AA代谢和AKT / FOXO1信号传导的变化。意义:我们的研究结果表明,HBx-K130M / V131I突变体变异通过激活AKT / FOXO1途径促进HCC进展,并通过花生四烯酸代谢诱导肝脏中更强的炎症。

8.Functional role of SGK3 in PI3K/Pten driven liver tumor development.(新靶点,分子机制,基础研究)

Xin Chen

Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences and Liver Center, University of California, UCSF, 513 Parnassus Ave, San Francisco, CA, 94143, USA. [email protected]

BMC Cancer. IF: 3.2880

BACKGROUND: 肝细胞癌(HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因。 PI3K级联是HCC发展和进展的主要信号传导途径之一。 PI3K催化亚基α(PIK3CA)的激活突变和/或Pten的丧失经常发生在人HCC中。血清和糖皮质激素激酶3(SGK3)属于AGK激酶的SGK家族,并且与PI3K下游的AKT平行起作用。以前的研究表明SGK3可能是PIK3CA螺旋结构域突变体(如PIK3CA(E545K))的致癌潜力的主要激酶,而不是激酶结构域突变体,如PIK3CA(H1047R)。

METHODS: 我们研究了SGK3在使用Sgk3敲除小鼠介导活化的PIK3CA突变体或Pten诱导的HCC发育丧失中的功能贡献。

RESULTS: 我们发现Sgk3的消融不会影响PIK3CA(H1047R)或PIK3CA(E545K)诱导的肝脏脂肪生成。使用PIK3CA(H1047R)/ c-Met,PIK3CA(E545K)/ c-Met和sgPten / c-Met鼠HCC模型,我们还证明了Sgk3的缺失适度延迟PIK3CA(E545K)/ c-Met驱动的HCC,而不影响小鼠中PIK3CA(H1047R)/ c-Met或sgPten / c-Met HCC的形成。类似地,在人HCC细胞系中,SGK3的沉默减少了PIK3CA(E545K) - 而不是PIK3CA(H1047R) - 诱导加速的肿瘤细胞增殖。

CONCLUSION: 总之,我们的数据表明SGK3在肝肿瘤发展过程中在转导螺旋结构域突变体PIK3CA信号传导中起作用。

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9.The Comprehensive Roles of ATRANORIN, A Secondary Metabolite from the Antarctic Lichen

Stereocaulon caespitosum

, in HCC Tumorigenesis.(天然产物,新药研发,新靶点,分子机制,基础研究)

Young-Jun Jeon

Comprehensive Cancer Center, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA. [email protected]

Molecules. IF: 2.8610

肝细胞癌(HCC)是最致命的遗传性疾病之一,但令人惊讶的是,针对HCC的化学治疗方法仅限于少数几个目标。特别地,考虑到化学药物开发在成本和时间方面的困难,强制寻找替代物以最小化努力并最大化抗癌疗法的效率。尽管有报告称已经分离出大约一千种地衣衍生的代谢物,但关于它们在癌症发展中的功能和后果的知识相对有限。此外,地衣中的一种主要的第二代谢产物,Atranorin从未在HCC中进行过研究。对此,我们通过采用代表性的HCC细胞系和实验方法全面分析了Atranorin的作用。使用该化合物的细胞增殖和细胞周期分析始终显示出Atranorin的抑制作用。此外,使用膜联蛋白-V和(碘化丙啶)PI染色的细胞死亡测定表明它通过坏死诱导细胞死亡。最后,该药物显着抑制了HCC细胞系的转移潜能。综合考虑这些因素,我们发现一种新的功能性发现,即Atranorin可全面抑制HCC的肿瘤发生和转移潜能,这可为抗癌治疗提供重要依据。

10.Anticancer activity and mechanism of total saponins from the residual seed cake of Camellia oleifera Abel. in hepatoma-22 tumor-bearing mice.(天然产物,新药研发,新靶点,分子机制,基础研究)

Ruyan Hou

State Key Laboratory of Tea Plant Biology and Utilization; School of Tea and Food Science & Technology, International Joint Laboratory on Tea Chemistry and Health Effects, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036, China. [email protected]

Food Funct. IF: 3.2470

我们以前已经证明了来自油茶种子蛋白的几种新皂苷。在体外表现出抗人肿瘤细胞的抗增殖活性。目前的研究调查了油茶残留种子饼中总皂苷的影响。 (TSSC)关于肝癌-22荷瘤小鼠的抗癌活性,发现TSSC诱导肝癌-22实体瘤小鼠癌细胞凋亡。在患有肝癌-22实体瘤的小鼠中,连续10天给予每日肿瘤内注射剂量为20μgkg-1,100μgkg-1或2000μgkg-1的TSSC,该方案耐受性良好。小鼠并显着抑制肿瘤生长。此外,TSSC促进实体肿瘤细胞凋亡,上调Bax蛋白表达,并下调Bcl-2蛋白表达,以响应荷瘤小鼠22实体瘤小鼠癌细胞凋亡的调节。同时,通过分子对接研究了TSSC中山茶花皂素B1,Bcl-2和MDM2之间的直接构效关系。经证实,C3上的糖苷配体是抗癌活性的主要来源。总之,这些结果表明TSSC可以在肝癌22肿瘤小鼠中表现出抗癌活性并增加癌细胞的凋亡,使其成为未来进一步研究后的潜在辅助药物。

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